La quinta e ultima stagione vede il Capitano Burnham e l'equipaggio della U.S.S. Discovery scoprire un mistero che li condurrà in un'epica avventura attraverso la galassia per trovare un antico potere la cui stessa esistenza è stata deliberatamente nascosta per secoli. Ma ci sono anche altri a caccia... nemici pericolosi che vogliono disperatamente reclamare il premio per sé e non si fermeranno davanti a nulla per ottenerlo.
Dopo un secolo di silenzio, scoppia una guerra tra la Federazione e l'Impero klingon. Al centro del conflitto c'è un ufficiale della Flotta Stellare caduto in disgrazia. Alcuni misteriosi eventi in diverse zone della galassia spingono poi la Discovery verso una nuova missione con un capitano ad interim: Christopher Pike dell'Enterprise.
